电影《特殊身份》以紧张刺激的情节，讲述了主人公陈子龙（甄子丹饰）在香港警方的卧底工作中，面临的危机与生死决战。

陈子龙是一名香港警察，他接受了一项危险的任务，那就是卧底混入黑社会，搜集关于黑社会大头目“雄”犯罪活动的情报。这项工作要求他出生入死，不断冒险，但随着时间的推移，陈子龙对这种生活感到厌倦，他渴望早日能够恢复自由身。

然而，黑社会组织的领袖“雄”渐渐察觉到组织内部存在卧底，于是开始对手下展开大规模的清洗，以排除异己。陈子龙深感自己的身份随时可能被揭露，急于联系上司张Sir（郑中基饰），寻求解脱。然而，张Sir却认为目前的情况是一个千载难逢的机会，可以全面瓦解“雄”的整个犯罪组织，他要求陈子龙尽最后的努力，继续卧底并协助调查他们在中国内地的犯罪活动，特别是在海南岛上的罪行，以便将他们全部绳之以法。

陈子龙和“雄”组织内最厉害的头目Sunny（安志杰饰）被派往中国内地，展开了一场冒险的调查。然而，他们很快就发现自己被一名神秘的杀手“刀锋”（张涵予饰）追杀。陈子龙陷入了极度危险的境地，生死悬于一线，他是否能够顺利完成任务，保护自己的身份，成为电影情节的高潮之一。